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[分享] 国内生物信息学领域或基因组测序相关的创业公司有哪些,其主营业务分别是什么?

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发表于 2025-4-16 11:54 | 显示全部楼层 |阅读模式
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发表于 2025-4-16 11:54 | 显示全部楼层
最近整理了之前的讲座和读文章笔记,恰好可能是问题需要的,尽可能附带创始人的情况。
资料来源基本上各种讲座,网站,如果有不对的的欢迎反馈,及时修改。但是这里面的公司肯定是不全的,毕竟这个赛道公司实在太多了。
PS,利益不相关,没有广告费,欢迎给广告费啊!!!

1、中科晶云, 中科晶云为科研工作者以及临床从业者提供测序以及数据分析的相关服务。 研发了相应的一体机,可以通过完全的一体化的操作精确地得到病人的突变位点以及对应的治疗方案。
赵屹博士,中科晶云首席执行官,中科院计算所PI、博士生导师,清华大学医学院博士,北京大学医学部医学硕士

2、至本医疗科技成立于2016年5月份,是一家精准医疗企业。该公司主营业务是通过国际化和标准化的质控平台,运用高通量二代测序检测技术等技术手段,进行癌症基因检测,并为患者提供个性化医疗咨询服务。至本医疗科技目前检测产品线设计有溯、源、至、本四大系列,实现肿瘤个体化用药咨询和动态监测等功能。
王凯博士 至本医疗科技创始人,哈佛大学/DFCI  生物信息学博士后,丹麦科技大学CBS/UCLA   生物信息学博士,白求恩医科大学  临床医学学士

3、慧渡医疗 一家专注于癌症早筛和个体化医疗的国际化高科技集团公司。公司创始人、董事长兼首席执行官贾士东博士是癌症研究领域的知名学者,任专业学术杂志Journal of Circulating Biomarkers的主编,在世界上首次发现p110b做为癌症治疗新靶点(Nature,2008)并直接推动了 p110b抑制剂的全球临床试验。 首次开发出 “ctRNA+ctDNA” 联合液态活检技术:基因雷达(Gene RADAR: RNA and DNA single molecule digital Reading ),通过二代测序精准检测血液中痕量存在的游离RNA和游离DNA上的基因变异,实现了癌症DNA基因组和RNA转录组水平的联合分子检测。
贾士东博士 慧渡医疗(Predicine)创始人、董事长兼首席执行官,哈佛大学博士后,协和医科大学博士。贾博士在基因泰克的研究工作中,发现基于Ion Torrent二代测序技术的AmpliSeq (v1)测序在临床样本里会导致若干重要致癌基因(如PIK3CA)的假阳性变异。

4、百世诺就定位在心脑血管分子诊断。 百世诺是中关村生命科学园第一家入驻到北大医疗产业园,第一家拿到“临床细胞分子遗传学专业”医学检验所资质,也是第一家赴中国医药城设立GMP生产车间的企业。三年多来,已积累近20000例单基因高血压、心源性猝死等相关疾病样本及完整临床资料,建立了中国人群最大的“单基因心血管病基因-表型数据库”和“世诺云”智能报告解读系统,获批“国家高新”“北京市科技研发机构”“北京市创新基金”“北京市新技术新产品”和二十余项发明专利、软件著作权等,服务客户遍及20余个省市,200余家医院、科研院所。
基于目前科学界对基因的了解,个体化用药和单基因病辅助诊断是基因检测在心脑血管领域有望快速临床推广的两大场景。2015年,心血管药物的国内销售额近2600亿,同期肿瘤靶向药物的总销售额不足100亿。心血管药物的种类和使用人数、频次也远高于肿瘤,因此潜在的用药风险更多。心血管单基因病超过300种,遗传风险高危人群超过3000万,是治疗以往“疑难杂症”,降低心血管病事件率、死亡率的重要突破口。
刘哲博士 百世诺(北京)医疗科技有限公司总经理,北京协和医学院博士

5、恒特基因开发了新一代技术平台PANO-SeqTM,并与中山市人民医院/中山市肿瘤研究所合作,对所收集的大型高危人群样本库进行ctDNA检测,期望以此增加我们对ctDNA与肿瘤动态发展关系的认识,为液态活检技术在肿瘤早期筛查中应用奠定基础。 而肿瘤分子诊断中最大的困难就是FFPE样本自身的局限性,样品中的DNA和RNA常常有模板断裂、模板损坏等问题,不但限制了一些检测方法的应用,而且测序结果中往往含有很多错误。基于这样的局限性,我们对技术进行了创新研发,针对医院的临床需求发明了基于二代测序的肿瘤分子检测AMP(Anchored multiplex PCR,锚定多重PCR)技术,现已被广泛应用于美国临床和科研,结果发表在Nature Medicine杂志上,目前已经成为麻省总医院主要的分子病理检测方法。AMP是一种为NGS生成富集目标序列文库的快速、简单、易扩展的方法。该技术可用于FFPE中的RNA、基因组DNA进行富集测序,可在数小时内轻松建成测序文库,且适用于各种类型及质量参差不齐的临床样本,特别是微量核酸样本,其构建的目标基因二代测序文库优于传统的多重PCR制备文库。AMP是在2012年完成实验设计,2013年进行大规模的临床验证。其间,Foundation Medicine于2013年在Nature Biotechnology上发表了他们的方法,我当时感到压力很大。据我所知,对于基因融合的检测,虽然有很多方法对某些样品、某些融合变异也能检测出来,但是至今没有其它方法像AMP这样,有系统性地大规模的临床FFPE样本验证,并达到100%的灵敏度和100%的特异度。正因为这样的结果,我的导师John Iafrate(以前为FDA编写FISH法检测基因融合的标准实验流程)在自己的实验室已经全面将FISH法替换成了AMP法了(FISH法至今仍是众多实验室的金标准)。
郑宗立博士恒特基因首席科学家,医学流行病学博士

6、2017年,该公司在全球运行25台NovaSeq、30台HiSeq X、10台HiSeq 2000/2500、10台PacBio Sequel,以及10余台其他型号的高通量测序仪,将实现每年28万人全基因组测序的超高通量。去年下半年,诺禾致源获得5亿人民币的B轮战略投资。今年3月底,诺禾致源医学检验所成功取得美国CAP官方认证,成为中国大陆地区首个顺利通过CAP认证的NGS实验室。
北京诺禾致源生物信息科技有限公司董事长李瑞强,李瑞强曾在华大基因工作了8年,从生物信息研究部组长做到副总裁。
成岗博士诺禾致源新任首席科学官(CSO),在清华大学化学工程系本科毕业后赴美国莱斯大学(Rice University)化学与生物分子工程系攻读博士学位。曾在百济神州、罗氏和基因泰克工作。

7、一家致力于消费级个人基因检测与生物信息分析的企业。 短时间内积累了近万例样本。 水母基因将基因检测与生物信息分析、大数据、人工智能技术融合,自主研发了精准健康管理SaaS服务系统
赵南博士水母基因联合创始人兼CTO,美国密苏里-哥伦比亚大学信息学研究所,生物信息学博士。曾于美国密西西比州立大学任计算生物学助理教授。

8、从检测技术来说,目前能够准确可靠地检测低至5~6个分子以下的游离DNA。在捕获测序方向上,相比罗氏的CAPPS,安可济开发的检测技术其敏感性和特异性都远远胜出,除了检测下限(LOD)5~6个分子(相当于20ng 游离DNA中0.1%的ctDNA含量,保证>90%检出率),还可以达到99.9999% 的特异性(相当于每测1百万个cfDNA分子,才有机会出一个错误)。在扩增子方向上,相比赛默飞的Oncomine Panel,除了特异性同样遥遥领先以外,林博士的团队率先解决了不限类型的ALK融合基因的ctDNA检测问题。
林博士明确点出了技术的核心优势所在,即Firefly™降噪原理,也就是“单链环化,串联纠错”,这决定了检测技术的高特异性。它不依赖于传统的分子条码(barcode)多个分子检出降噪,而是依靠同一分子的串联重复体(concatemer) 精准检测突变, 如此一来,在测序深度相对较低的情况下也可以准确检出低丰度突变,这在cfDNA检测领域是尤为重要的。
安可济联合创始人林盛榕, 科研总监赵奇志、业务发展副总裁邓凌峰(Paul Tang)、总裁兼CTO林盛榕、董事会主席兼CEO应康、执行副总裁兼CIO孙朝辉。

9、MALBAC®技术利用某种环状结构将副本的复制锁定,让拷贝无法复制自己,所有的拷贝只能来自母本。历时两年,在无数次的失败中不断改进,成熟的MALBAC®技术最终被研究出来,与传统技术比起来,准确性和覆盖度都要好很多,对肿瘤细胞的DNA检测覆盖度高达93%,通常的技术手段只能做到50%~70%。据悉,陆思嘉博士已成功将该技术运用于了辅助生殖、肿瘤研究等领域,并推动了单细胞测序的研发和应用。 截至2017年,亿康基因运用该项技术成功阻断遗传病150余种,已帮助2000多个家庭获得健康的宝宝。
亿康基因总经理兼联合创始人陆思嘉博士,本科就读于复旦大学,后在哈佛大学从事生物化学研究并取得博士学位,在此期间,他发明了多次退火环状循环扩增技术(MALBAC),并应用该技术在辅助生殖、产前诊断、优生优育等领域取得了重要进展。

10、华点云从成立之初就聚焦于微生物检测在各领域的应用。自主开发生物信息和IT技术结合的CelLoud生物信息云平台(一横),同时和客户一起开发针对性的应用试剂盒(一纵),在各个检测终端为客户生成自动化、个性化的NGS检测报告。
目前生物信息大数据压缩、数据传输、存储和分析各环节都存在一些瓶颈,包括Intel、伯克利大学在内的诸多企业和学术机构都在积极研究探索。在数据压缩方面,相关人员正在研究新的压缩算法,实现基于FPGA软硬件一体的压缩方案;传输方面,带宽成本与高效的传输协议仍未很好的解决;存储方面,存储格式并不能有效用于分布式大数据框架处理;分析方面,基于分布式系统下的各类生物信息分析算法和工具都还不成熟,不能用于生产环境。
华点云CEO张端阳,2004 年毕业于中国科学院遗传与生育发育学专业.曾任 Bio-Rad 大仪器部北区销售总经理;Illumina 公司北区销售副总监

11、一是开发了基于三个不同技术平台的三类产品系列,产品梯队构建非常清晰,是基于长时间的市场调研、目标受众的需求分析作出的选择,希望消费者明明白白知道自己选择的产品,是基于什么技术手段,具有哪些优缺点;二是开发了公司专属的全测序信息解读系统,可以实现15小时内90GB原始数据的全面解读。同时,得益于整个科研团队非常扎实的专业功底和深厚的基础研究,23GENEBANK目前的全测序产品,拥有近900余项检测项目,涵盖了遗传疾病、肿瘤易感性,精准用药、营养环境四大方向,并且还在进一步增加。
23GENEBANK高级科学家钱夔,曾在丹麦从事多年NGS研究

12、目前已有80%的在血液病领域排名前200的医院和肿瘤相关医院在使用睿昂的产品,我们的营销网络遍及全国,有十一个产品在CFDA报证中,除了血液肿瘤相关的,还包括肺癌、肠癌、脑胶质瘤、药物基因组学等相关检测产品。在写这篇文章之际,睿昂又得到了辰德资本与易凯资本的青睐,融资数亿
上海睿昂总经理熊慧,上海第二医科大学附属瑞金医院上海血液学研究所毕业,Burnham Institute for Medical Research博士后。曾参与国家人类基因组南方研究中心疾病与健康省部共建实验室的创建工作,担任上海申友生物技术有限责任公司负责人等。                                       

13、用二代测序来识别肿瘤基因组中的变异也存在着很多挑战:健康组织的污染、DNA片段降解、肿瘤的异质性、肿瘤基因组变异的多样性等都需要在分析时针对肿瘤的特征进行相应的调整。有时甚至需要对肿瘤基因组进行重新组装来正确地识别大片段结构变异。
我们不仅做NGS测序和数据分析,同时需将基因信息与临床对接,搭建优质的个体医疗数据库,包含疾病基因组学、药物基因组学、基因变异数据库、治疗回访数据库。从PubMed、COSMIC,NCCN指南,FDA,ClinicalTrial,DrugBank等多个数据库中,我们由专业团队人工教验收集,有严格的收录质控标准和流程,经多方审核,可以说是最精细、最结构化的高效对接临床,对分析结果出具临床解读报告。 研发的iCMDB已被新加坡健康科学局授予医疗器械级别的资质—— ISO13485资质认证。目前已被国内解放军307医院、301医院、人民医院、同仁医院、武汉同济医院血液科等,国外新加坡中央医院、新加坡国立医院、美国西奈山医院、泰国Ramathibodi医院等接受或进行合作。目前数据库包括多种实体瘤、血液癌症、线粒体基因病、传染病、孟德尔式遗传病、疾病风险预测,以及150种药物的药物基因组学数据,包括化疗、放疗、靶向治疗方案、激素治疗、细胞免疫治疗、疾病进展监控及预后分析、抗药性分析。
全雪萍: 为朔医学Vishuo首席技术官、英国帝国理工大学资深生物信息学家、爱丁堡大学信息学院博士后研究员
朔医学大数据CEO郝占平:专门建立基础医学成果转化到临床应用的桥梁。换句话说,基因检测完成后怎么和临床对接呢?这就是我的任务和使命。

14、优迅医学是国内少有的同时拥有CTC和ctDNA检测核心技术的第三方医学检测机构
优迅医学CEO周晔,新墨西哥大学生物医学PHD,并在美国希望之城从事分子药理学相关的博士后研究,拥有10年以上的分子生物、细胞生物学转化研究专业背景

15、谱元科技在2012年中就做出了可能是全球第一份的肠道微生态检测报告,2013年又给北京一家公司做出了第二版检测报告
创始人覃俊杰,做微生物检测,研究宏基因组,原华大基因微生物项目负责人

16、上海伯豪。为了加快上海伯豪的发展和社会化、市场化进程,在2012年,公司完成了第一轮融资,引入了社会资金3000万元。在2008年底,为了整合资源,加快发展,加强研发外包的服务和引入社会资金。上海生物芯片有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心以基因芯片部技术平台和国内的技术服务体系为核心,整合了国际销售团队,并把技术服务的业务进行剥离后成立了上海伯豪生物技术有限公司,负责芯片中心研发外包的服务业务。
2012年,上海伯豪和上海生物芯片有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心共同出资合办了上海伯豪医学检验所,希望能够向临床方面拓展。2013年获得置业许可,2014年初获得执业许可,开始承接对外服务业务,从经营情况来看,还不错。去年完成了七百万的销售额(2014年),今年销售额已经翻了一倍(2015年)。公司未来的业务:一个是科技服务,另一个就是疾病和健康的临床服务。 最近公司完成第二轮融资,本轮投资由团队和新股东上海东富龙医疗科技产业发展有限公司共同增资,增资额1.05亿。
上海伯豪董事长肖华胜

17、北京希望组为遗传病患者及其家庭服务,帮助减少出生缺陷,理解患病的病因,降低遗传病家庭的痛苦,消除第二胎生育的不确定性,也唤起社会对罕见病的认知与关心。
武汉未来组到现在为止,我们已经做了上百个三代测序的科研服务项目,在动植物基因组、小基因组、全长转录组、人类基因组等领域的三代测序技术积累一直处在了国内领先的地位。尤其是2015年底,PacBio 公司推出了新的测序仪,测序通量增长7倍,测序的成本进一步降低,我们武汉未来组也会做为第一批构建新三代测序平台的公司,继续开拓三代测序的科研服务和医学诊断应用领域。
武汉未来组生物科技CEO汪德鹏

18、当时NGS技术和基因捕获技术的完美结合,开发出临床遗传疾病如神经肌肉病、遗传代谢病、内分泌代谢病、心血管病、血液系统疾病等级肿瘤系统疾病捕获试剂盒,配合各领域临床专家寻找新的致病位点或新的致病基因。因此,我们迈基诺是第一家在国内用高通量测序推动基因组临床应用和临床研究的公司,目前我们检测的样本数已达到2万例。
迈基诺创始人伍健,在北京大学完成本科学习,在美国哥伦比亚大学完成博士研究生学习,在美国著名的约翰霍普金斯大学完成博士后训练,就职于约翰霍普金斯大学癌症研究中心兼职助理教授, 同时被聘为第四军医大学特聘教授

19、十年间,我们整合了诸多技术平台,其中NGS为最新,它的重要性不言而喻,在未来的分子诊断领域必将会起到决定作用。当然,它不是一个全能的平台,因为其不能完全替代其它所有传统的分子平台。我们已经整合的平台包括qPCR,FISH,IHC,NGS,还有比较新的ddPCR,这些技术都是分子病理或者分子诊断大平台所需要的。
雅康博CEO许军普,1993年毕业于清华大学生物系;2000年获得美国CTU大学MBA学位;2004年创建北京雅康博生物科技有限公司并一直担任首席执行官;许军普先生先后就职于诺华制药(Novartis Pharm-aceutical)和英国诚毕市场投资有限公司(China Biomedical Marketing & Inve-stment Ltd.)北京办事处,之后在英国诚毕投资的子公司——和杰医疗器械有限公司工作了7年。

20、2012年决定往个体化医学上发展,并成立了北京圣谷同创科技发展有限公司。为了让公司有一个好的起点,当时我卖掉了自己的房产。我们购买了48台Life Technologies 公司(后并入Thermo Fisher)的半导体芯片测序仪,成为其Ion Torrent PGM和Proton 上市后全球第一个大用户。 使用NGS这一检测新方法我们已经积累了近4万余例的中国人群数据库,其中肿瘤3万逾例,单基因遗传病1万逾例。
我们的模型和数据库正在逐步完善建立,血浆ctDNA在肺癌上测序准确度达99.99%,检出率III—IV期肿瘤患者>83%,I—II期肿瘤患者>65%,现在我们正在完善相关试剂盒和软件。 我们多囊肾基因检测研究也处于国际领先地位,由上海长征医院肾科梅长林教授牵头共同组织的科研项目组,多囊肾检测准确率可达到99.99%,检出率高达90%以上(国际上平均在60-70%)检出率就是灵敏度
圣谷同创董事长史荣

21、在产品和技术体系的建设上,安诺优达做的是基因组学,一直围绕以高通量测序和生物信息为核心技术进行研发和商业化,紧密地结合了两个点来做事情,一个是时间点,另一个是切入点。也就是基于这两点,我们当时选择了从NIPT进入。现在在生育健康、肿瘤个性化治疗、遗传性疾病筛查、科技服务等方向也推出了针对性的技术和产品。从纯粹技术角度而言,这些技术有胎儿游离DNA测序、肿瘤循环DNA测序、单细胞测序和Hi-C分析等。
安诺优达基因科技创始人梁峻彬,安诺优达基因科技(北京)有限公司首席运营官。2004年-2009年在中山大学攻读生物化学与分子生物学博士学位。2012年4月份在北京经济技术开发区创办安诺优达基因科技(北京)有限公司并担任首席运营官。梁峻彬有超过12年的分子生物学领域研发和商业经验,拥有发明专利超30项,软件著作权超15项,曾主持和参与多项北京市生育和肿瘤相关基因诊断技术的研发课题。

22、奇云科技是一家专注于基因数据大健康的人工智能公司,提供最为全面的生物信息分析应用和一站式生物大数据平台,以此实现健康数据的挖掘,推动精准医学的发展,让数据真正为精准健康管理服务。在国内领先上线了SaaS平台和DNA APP Store,首推健康管理一体机和精准医学一体机。旗下包含奇云诺德和基因空间两个品牌,奇云诺德主打高端全基因组数据服务等健康类基因产品,基因空间则是国内更大的基因行业垂直媒体社区。
奇云科技创始人罗奇斌,《互联网+》丛书联合作者和《互联网+基因空间》主编。中信出版社《互联网+医疗》联合作者。贝壳社BioMan成员。基因空间微信公众号和基因世界APP的内容主编,2007年获得浙江大学沃森研究院生物信息学硕士学位,2008年获得德国DAAD全额奖学金赴慕尼黑工业大学生物信息学系攻读博士学位,专注于二代测序技术和互作网络在基因数据中的应用。2014年离开中科院创办奇云生物(QY Genomics)和奇云诺德 (QY NODE),专注于通过互联网技术和生物信息分析技术帮助每一家生物企业,打造基因行业的工业4.0。


23、裕策生物致力于提供最领先的肿瘤基因组学解决方案。天梯计划”由聚焦肿瘤基因组和免疫治疗的领先技术企业裕策生物发起,旨在利用基因检测和大数据分析,调动免疫系统抗击癌症能力,加速癌症治疗研究,实现治愈癌症的登月壮举,建设合作、互利、共赢的抗癌“天梯”。预计到 2020 年,“天梯计划”将实现“两库一标”的战略目标,即建立国内首个万人级别的 3D 肿瘤数据库、国内首个专业全面、更新及时的肿瘤免疫知识库,并建立国内首个开源、开放的肿瘤免疫治疗基因检测评测体系和标准,进而为临床肿瘤治疗的科学家和医生提供辅助治疗决策,为药企开发药物提供可信靶点选择,加速最新的癌症免疫疗法,实现肿瘤防治的跨越式突破。
裕策生物创始人高志博,毕业于香港中文大学,获得医学科学博士学位,曾任华大基因科技服务医学研究部总监,全面负责肿瘤基因组科研合作工作。高博士是国际肿瘤基因组协作组(ICGC)成员,是中国肿瘤基因组协作组(CCGC)重要成员。

24、百迈客已经是一个拥有500人的专业从事基因检测和基因大数据管理挖掘的国家高新技术企业,5000余平米的5A级写字楼办公区,全套的二代测序仪和三代测序仪为公司发展提供了一流的平台。百迈客云是国内第一家正式商用的生物云平台.
百迈客创始人郑洪坤,原华大基因科技服务负责人

25、深圳瑞奥康晨的团队有20多人,涵盖生物、医学、计算机、数学等各学科背景,
业务1)面向医疗、科研、健康的生物医学大数据分析服务,简称科研服务;2) 基于高通量测序技术的心脑血管疾病的风险预测、早期和预后检测、个性化用药指导、遗传疾病检测服务。 瑞奥康晨基于优质的临床及科研资源,完备的技术储备以及国内外顶级的专家顾问支持,结合当前最新的研究成果,研发出了一系列针对健康人群应用的基因检测产品,让基因检测从科研应用真正走向“大众应用”。对不同的应用需求及人群,瑞奥康晨设计了针对性的应用方案。我们不仅为您进行“基因检测”,更重要是的为您提供持续的解读咨询服务及精准的健康管理建议方案书。
深圳瑞奥康晨创始人、前华大科技COO杨旭,江西南昌人,生于1981年10月13日。2008年毕业于中国医学科学院北京协和医学院(清华大学医学部)心血管病研究所阜外心血管病医院。同年加入华大基因,先后担任健康事业部技术专家、华大基因人类疾病研究方向总监、华大科技首席运营官。于2015年5月创办深圳瑞奥康晨生物科技有限公司及南昌瑞因康生物科技有限公司。

26、海普洛斯已完成深圳研发总部、第三方医学检验所、GMP生产车间、美国研发中心、海普洛斯基因组中心以及上饶国际精准医疗健康产业园的多中心全球化布局。公司投资数亿元引进全球最先进的Illumina NovaSeq 6000、HiSeq X Ten、NextSeq 500/550系列测序平台和数字PCR平台,成功打造了全球顶级基因检测中心。目前,公司测序通量亚洲前三,肿瘤基因数据产出量居全国前列,业务覆盖20多个省份逾100+顶级三甲医院。合作医院包括深圳市人民医院,北大深圳医院,中山肿瘤,广州医科大学附属第一医院,南京军区总医院,浙江省肿瘤,北京协和,北京301,北京肿瘤医院,华西医院,重庆大坪医院等。
海普洛斯CEO许明炎,江西上饶县人,80后,美国新墨西哥大学生物医学博士,曾就职于美国Cambrian Genomics公司,担任二代测序科学家,开发出全球第一台能够回收DNA的测序仪。

27、在精准医疗理念的推动下,元码基因在肿瘤分子诊断领域成功推出了基于创新技术的“济康”、“济克”、“济安”系列肿瘤基因检测产品,涵盖肿瘤早筛早诊、精准用药、实时监控等内容,实现了肿瘤精准医疗的全方位检测,最大限度的满足不同阶段肿瘤患者的需求。此外,元码基因还成功开发出液态活检10K系列产品,采用具有自主知识产权UCap、DeCap、TCap核心技术,实现了肿瘤无创检测,并首先提出“四定液体活检”(“定性”、“定量”、“定位”、“定序”)的新一代液体活检理念,为临床无创肿瘤基因检测开启了全新模式。
元码基因田埂,中国科学院基因组学博士,现任元码基因科技(北京)有限公司联合创始人CEO。曾任华大基因华北区第一负责人,天津华大创始人总经理,深圳华大基因研究院研发副主管,清华大学基因组与合成生物学中心主管。参与多项863、973项目。以通讯作者和第一作者在《自然》等杂志发表文章10余篇,拥有发明专利10余项。

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发表于 2025-4-16 11:54 | 显示全部楼层
从我知道的纯数据分析领域来说(只靠数据分析吃饭的公司),比较早的是敏芯的,老板好像是仲阳的学生,大约在09年的时候还挺活跃,不过后来一直没什么新东西出来,最近很少见了,听说最近也是各种搞,培训班啊等等。
其明也是比较早的,老板是上芯出来的,个人能力突出,火了一阵子,后来听说有了AFFY的实验平台,做的还不错,分析有些特点,不过10年以后的册子好像一直没什么新的东西出来,有点吃老本的感觉,测序好像不怎行。
很早北京还有家叫与翔科飞的,情况不是很了解,听说也去做测序了。
后来华大系列的出来了一批,比如诺和,李瑞强名气就比较大了,还有贝瑞,百脉克……从分析来说,和华大的体系高度相似。不过贝瑞还是比较有趣的,进军了个体化医疗,估计有上市的可能。诺和还在科研系统做点东西。
烈冰信息好像是上海交大的几个博士出来搞的,好像是自己研发了分析系统,发表了一些算法相关的文章,文章发表势头和研发势头还不错,听说后来自己买了IonProton测序仪,不过感觉是一群穷小子,没多少钱,不过听说实验是一家叫基研的公司在推。
还有天津TBC,好像微生物方面比较有优势,好像是一个南开的长江搞得,不过教授搞的公司,运行的名气不大。
苏州众信,其实算是比较早的纯生物信息公司了,李义学搞得,早期和敏芯,其明还老出现,后来转型做二代测序了,13年就比较少见了。
武汉生命之美,好像是一个被开除的教授搞的,CLIP-Seq搞的不错,听说是个病毒方面的高手,发展势头越来越好,看来全职和兼职就是有区别哈。
美吉生物是一家比较大的测序公司,老板听说是英俊出来的,早期做一代测序,近期做了二代测序,擅长微生物测序。
后面纯的生物信息公司几乎难找到了,都是测序劲旅了,不过测序也好,芯片也好,生物信息也好,本来就是一个产业链上的,纯的数据分析公司几乎没有了,这也很正常,毕竟数据分析不赚钱嘛,大家都在搞实验了,主营业务上也基本在依托实验在做。
基因芯片:博奥,上芯,康成是目前市场上的3大劲旅,其中博奥实力最强,应为他们又自己的芯片,当然也搞AFFY,安捷伦,康成是民营芯片公司的代表,也自己有拳头产品,LNC芯片。其明主要是卖AFFY的,也搞点芯片的数据分析。还有一些做华联芯片的,比如卓力等,但是还有一个劲旅,就是基因公司,代理AFFY的,市场占有率不小。
二代测序:华大基因,就不解释了,航母。   华大技术体系的贝瑞(个体化医疗方面除外,这里主要指科研用户),诺和,擅长非模式物种拼接,百脉克。美吉,偏向于微生物。南方基因中心,当时号称与华大一南一北,现在被华大甩开了。基研(烈冰),擅长转录组测序及数据分析的应用。佰真生物,贺林嫡系,教授公司不评价。广州锐博,在南方有一定占有率,测序及芯片业务是其业务中的一部分,最早做细胞相关的实验起家。派森诺,交大一教授搞的,好像就是桑尼,不评价。千年基因,韩国人开的公司,不评价。苏州众信,交大礼仪学的公司,以前也做些纯的数据分析,在教授公司里面算是做的时间比较长的,近期好像不怎么听说了。药明康德,主要接药厂的生意,在测序领域,算是新生力量。
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发表于 2025-4-16 11:55 | 显示全部楼层
剑桥大学的James Hadfield利用Google地图制作了一个高通量测序仪世界分布图,非常直观地展示了
高通量测序仪的数量及在各个国家和地区的分布情况,这为有意采用高通量测序技术进行生物学研究的学者提供了重要参考。
High-throughput sequencing maps
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发表于 2025-4-16 11:55 | 显示全部楼层
国内高通量测序服务公司表
1.    华大基因
        137台Hiseq;3台Miseq;27台Solid; n台Proton
        全方位高通量测序应用
        联系方式:400-706-6615,info@bgitechsolutions.com

2.    药明康德基因组学中心
        4台Hiseq;4台Miseq;1台PGM。
        科研服务、测序外包服务、药企测序服务、Affymetrix生物芯片服务
        联系方式:021-50461070,genome@wuxiapptec.com

3.    贝瑞和康
        5台Hiseq;1台Miseq。
        无创产前诊断、科研服务、Illumina生物芯片服务
        联系方式:400-610-8005,info@berrygenomics.com

4.    诺禾致源
        5台Hiseq;2台Miseq。
        科研服务、农林行业测序服务、De novo专家
        联系方式:010-82837801,support@novogene.com

5.    安诺优达,
      3台Hiseq。      
      无创产前诊断,科研服务
      联系方式:010-56315326, service@annoroad.com

6.   北京药用植物所,
      1台PacBio,真正的三代测序仪,单分子测序仪。
      联系方式:010-57833028

7. 康圣环球,Illumina官方临床合作伙伴,N台Hiseq,并同时有Ion Torrent平台。大型医学检验服务商。400-736-166
8. 达安基因临检中心,6台Proton,1台PGM,1台专门做SNP和甲基化的MassARRAY(SEQUENOM)。广州爱健(达安子公司)。2台Proton, 2台PGM。地中海贫血分析。联系方式:020-84115301
9. 北京大学 Biopic 中心,3台Hiseq,
10. 新培晶上海医学检验所有限公司,1台Hiseq, 1台Miseq。医学检验服务商。021-60321600
11. 上海南方基因中心,1台Hiseq,2台454,新采购1台PacBio。021-50801919
12. 上海佰真公司,1台Hiseq,1台Miseq,1台PGM,1台454。021-54072242
13. 广州锐博生物,1台Hiseq, 1台Miseq,1台PGM。400-686-0075
14. 上海凡迪生物,1台Hiseq 2500, 1台Proton, 1台PGM,产前诊断服务商,4006-830-321
15. 中科院北京遗传与发育所,1台Hiseq,1台454,1台Miseq,1台PGM。010-64806501
16. 上海美吉,1台Hiseq,1台Miseq,2台454。微生物测序,宏基因组测序。联系方式:400-660-1216
17. 上海生物芯片公司/伯豪公司,1台Hiseq,1台Roche 454 FLX。联系方式:021-51320288
18. 上海晶能,1台Hiseq。外显子组测序,Illumina生物芯片服务。联系方式:400-720-8232
19. 苏州众信,1台Hiseq。微生物测序。联系方式:0512-62825492
20. 北京理化中心,1台Hiseq。010-58717615
21. 上海康成。1台Hiseq。Exiqon指定中国服务商,生物芯片服务商,microRNA专家。021-64451989
22. 北京博奥(北京生物芯片公司)。1台Hiseq 2000。专业生物芯片服务商。010-80715888
23. 中科院上海分院,1台Hiseq。
24. 中科院基因组所,1台Hiseq。010-84097710
25. 中科院遗传发育所,1台Hiseq, 1台Ion Torrent, 1台Roche FLX. 010-64806501
26. 中科院国家基因研究中心(水稻基因中心),上海市漕宝路500号,1台Hiseq, 021-54971303
27. 上海派森诺,1台Miseq,1台454。De novo, 宏基因组测序,RNA-seq专家。021-61919859
28. 中科院北京基因组所,1台Hiseq,010-84097326
29. 上海宝藤生物/上海张江转化医学研发中心,1台Hiseq。021-50277728
30. 复旦大学医学院,1台Hiseq,明道楼5楼
31. 浙江大学医学院,1台Hiseq 2000。
32. 金唯智,1台Hiseq。一代测序服务商、寡核苷酸合成服务商。400-8100-66
33. 中科院昆明动物所,遗传资源与进化国家重点实验室,1台Hiseq
34. 中科院上海逆境生物中心,1台Hiseq, 1台Miseq
35. 上海天昊生物。1台Miseq。遗传分析,SNP分析专家。联系方式:400-065-6886
36. 尤尼曼,1台Miseq, 4008-213-671
37. 张宗峰,1台Miseq,
38. 英骏生物,1台PGM。一代测序、寡核苷酸合成服务商,Life Tech公司子公司。800-820-8982
39. 联合基因,1台PGM。健康咨询。021-33721110
40. 中美泰和,1台PGM,010-52213160
41. 生工生物,1台PGM。一代测序服务、寡核苷酸合成服务领导品牌,常用生物耗材生产商、分销商。021-37772169
42. 金域检验,1台PGM.大型医学检验服务商。4001-111-120
43. 赛哲生物,1台PGM。论文图文美化。400-888-4242
44. 华冠生物,1台PGM。021-51320288-9371
45. 吉玛生物,1台PGM。shRNA合成服务商领导品牌。021-51320195
46. 千年基因,在韩国有30台以上的Hiseq。0755-23067982
47. 奥拓基因,在美国有2台Hiseq,  021-54117669
48. 北京百迈客。De novo专家,农林基因分析专家,品种遗传改良服务专家。联系方式:400-600-3186
49. 北京迈基诺基因科技有限公司。健康服务。联系方式:010-56265283
50. 科诺检验、科贝生物、苏州生物医药创新中心,这三家是同一个实体。主要从事医学检验、产前诊断。0512-69561999
51. 北京博莱明创生物技术有限公司,010-86982722
52. 广州瑞科基因。020-62197097
53. 武汉未来组。De novo专家,生物分析专家。 联系方式:027-87778707
54. 上海其明信息公司。Affymetrix指定服务商,生物信息专家。 联系方式:400-604-0030
55. 广州基迪奥生物。生物信息服务商。020-393340225
56. 杭州锐创生物技术有限公司,二代测序,生物芯片,057186971763
57. 上海敏芯公司。生物信息学服务,代谢组实验。021-31523052
58. 北京市计算中心。生物信息服务。联系方式:010-59341768
59. 上海烈冰公司。生物信息服务商。021-60515125
60. 青岛生物能源与过程研究所徐建 构建MP library(Mate Pair library),0532-8066265173.
61. 上海欧孚。建库服务,多种核酸抽提服务。13795382662
62. 北京毅新兴业。Sequenome质谱服务。联系方式:010-82608397
63. 凯基生物。025-52880816
64. 上海阿趣生物。13671816267
65. 艾博斯.
66. 博仕生物医学中心
67. 博苑生物
68. 上海丰核信息,课题设计,论文撰写,生物信息分析。
69. 上海朗通生物
70. 上海锐金生物医药科技有限公司
71. 赛业生物,曾经是Complete Genome公司在中国的代理商
72. 上海生咨
73. 翼科
74. 上海英拜生物
75. 武汉生命之美
76. 苏州帕诺米克生物公司,0512-62959105
77. 北京源泉宜科生物科技有限公司, 13436320880
78. 凌科生物,环境基因组/宏基因组数据分析,021-31171173
79. 上海泉脉生物科技有限公司,二代测序,生物芯片,021-54038325
80. 拜珐(上海)信息技术有限公司,二代测序,生物芯片,021-34315602
81. 无锡艾吉因生物信息技术有限公司,自行设计的测序原理和测序机器,0510-85386921, 中国人自主知识产权的产品,特别支持
82. 杭州联川生物,生物芯片服务商,代销二代测序,0571-87662413
83. 深圳华因康基因科技有限公司,自行设计的测序原理和测序仪,0755-26611270, 中国人自主知识产权的产品,特别支持
84. 北京康普森生物技术有限公司,010-61199509
85. 博淼生物科技(北京)有限公司,4006-506-908
86. 上海欧易生物科技有限公司,生物芯片服务商,021-20283908
87. 派利来生物,010-59706036
88. 武汉菲沙基因信息有限公司,生物信息服务商,027-87224765
89. 杭州英睿,0571-88173602
90. 武汉大众源生,027-87297418
91. 天津生物芯片,022-66229538
92. 达迈生物,Illumina分销代理商,021-51871699
93. 仁科生物,Illumina分销代理商,021-34250079
94. 北京怡美通德,Illumina分销代理商,010-84409662
95. 北京华生恒业科技有限公司, 生物信息学软件销售商,010-8260 1104
96. 北京圣谷同创,N台Proton + N台PGM?, 010-58815976
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发表于 2025-4-16 11:56 | 显示全部楼层
这个行业发展还是很快的,目前国内有仪器平台且进行商业化服务的公司机构估计有近二十家了吧?这还只是国内的不包括千年基因这种国外的公司。
      有自己仪器平台且比较大的公司最早那批都是有国家的单位做背景的或密切相关的,比如目前国内市场占有率较高的BGI这个地球人都知道,是当初的北方中心,现在的诺赛就和北方中心有密切联系。然后生物芯片国家工程中心的上海中心是上海生物芯片公司,旗下的伯豪是做芯片和测序的,又整合了上海生物芯片公司的另一子公司南方基因;生物芯片国家工程中心的北京中心是博奥公司,在北方地区占有率较大。
      上面的几个历史“悠久”的公司中很多中高层员工都出去创业了,就我知道的说一说:

      华大系:最有名的的现在应该是诺禾致源(李瑞强)和贝瑞和康了吧。其他的有安诺优达、未来组、百迈客等。这个应该让
@GentleYang 杨振涛
@陈钢 来说说哈。
      上海生物芯片公司系:与测序相关的我知道的有上海的欧易生物、晶能、其明,北京的康普森等,好像康普森的老板之一也在贝瑞和康呆过。欧易、晶能、其明都是上海生物芯片公司的销售高层出去创建的。前两者有自己的测序平台(有的没有所有权有使用权)。其明公司是国内成立的比较早的专门做高通量生物数据分析的公司,成立于2005年年底,专门做生物芯片及高通量测序的数据分析,直到2011年才建立了Affymetrix的芯片平台算是有了wet lab。现在从其明公司也出走了一些人建立了自己的公司,一个是上海烈冰,发起人除其明公司原员工外还有上海交大的几个博士。另一家算是其明系的公司在北京,北京中康博,似乎2012年才成立。
      做纯粹的数据分析公司还有上海丰核和上海敏芯,不过印象中敏芯一直靠办培训班赚钱和使用客户不知道的免费软件来进行服务,不知现在发展得如何有无自己的研发产品了。上海丰核是上海交大几个博士自己创办的公司,去过一次很朝气蓬勃的感觉。
      苏州众信与上海生物信息中心有密切关系。据小道消息说上海生工和欧易等的454测序数据都是众信的人帮分析的。
      上海派森诺是上海交大老师建立的。上海佰真也是,佰真背靠上海交大的Bio-X中心,平台那叫一个多啊看得口水哗哗的(不过再多也没BGI多哈哈)
      上海其他公司还有康成生物、美吉生物,上海生工2011年的时候听那里的人说要买测序仪不知买了没有。还有个天昊生物是复旦大学金力实验室的几个博士创办的,发展得很不错。
      Lifetech、联川这种国外公司就不说了。韩国千年基因最近把市场价格打压得很厉害,我甚至都怀疑是不是为了得到数据才这么便宜的……不过做的客户不多,因为要把样本送到首尔去做,有的客户跟我说样本出国怕被基金委知道了再也申请不到基金了哇哈哈……
      还有一些研究机构也进行商业化测序及分析服务比如北京计算中心,我习惯性把药明康德也算这类里,都是兼职服务的哈。
      广州赛业一直是做干细胞和转基因小鼠的,现在在苏州太仓成立了子公司也做测序服务,是Complete Genomics的代理。公司的办公地点就在太仓市生物信息中心的楼里。
      还有一些比如深圳华因康、武汉生命之美等就是只知道名字其他啥也不知道了……
      居然写了这么多,本来只想休息五分钟的啊……抛砖引玉了吧,刚来知乎,生信行业的人不是很多啊……
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