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分子诊断试剂中的“酶”你不行
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分子诊断试剂中的“酶”你不行
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发表于 2024-9-27 09:07
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在做分子实验,谁也缺不了对基因进行定量定性,PCR是最经典的方法。然而实验结果是否可靠并好看和分子酶的质量是绝对相关。
聚合酶链式反应(PCR)是一种用于放大扩增特定的核苷酸片段的分子生物学技术,它可看作是生物体外的特殊核苷酸复制,PCR的最大特点是能将微量的核苷酸进行大幅扩增,从而达到容易鉴定和识别程度。
PCR到底需要哪些种类的酶?请看中心法则,分子生物学的中心教条。体外的各种聚合酶链式反应就是中心法则的完美运用。
DNA聚合酶——又称DNA依赖的DNA聚合酶
它是以DNA为模板,催化底物dNTP分子聚合形成子代DNA的一类酶。DNA聚合酶根据聚合酶活力特征和外切酶活性特征的不同,有可以分为多种。在IVD领域中比较常见的酶如下:
Bst DNA Polymerase (Large Fragment)
Bst DNA聚合酶是来源于源于 Bacillus stearothermophilus DNA Polymerase I,通过基因工程手段去除了其5'-3'外切酶活性,而保留了5'-3'聚合酶活性。该酶具有很强的链置换能力,因此是Isothermal amplification (LAMP, RT-LAMP)的绝佳用酶。与野生型Bst DNA聚合酶(大片段)相比,该酶在扩增速度、产量、耐盐性和热稳定性等方面均有大幅提高,同时,该酶可以使用dUTP作为底物进行扩增(Bst大片段无此活性),非常适合于防污染的等温扩增反应。
由于此次新冠的影响,Bst成为IVD领域内又一个DNA聚合酶宠儿。
Bsu DNA Polymerase (Large Fragment)
Bsu DNA Polymerase (Large Fragment)保留了Bacillus subtilis DNA聚合酶I的5'→3' DNA聚合酶活性,但是缺失了5'→3' 核酸外切酶结构域;该大片段自身缺乏3'→5'外切酶活性,是具有链置换活性的DNA恒温扩增聚合酶。
逆转录酶——又称为RNA依赖的DNA 聚合酶
该酶以RNA为模板,按5'-3'方向合成一条与RNA模板互补的DNA单链,这条DNA单链叫做互补DNA (complementary DNA,CDNA)。
先达基因逆转录酶是来自莫洛尼小鼠白血病病毒(Moloney Murine Leukemia Virus)经改造的RNA导向的DNA聚合酶,保留了该逆转录酶的RNase H活性,RNase H可以特异性的水解DNA-RNA杂合链中的RNA;提高了热稳定性,耐受温度可达55℃;并具有极强的延伸能力,可以高产量制备全长的第一链cDNA,产物cDNA可从100 bp-15 kb。
一款PCR/RT-PCR必加的UNG
Cod UNG(热敏型尿嘧啶-DNA糖基化酶)是来自Atlantic Cod的Cod Uracil-DNA糖基化酶,能在室温下有效地水解单链或双链DNA上的尿嘧啶,对RNA无活性。Cod UNG对RNA无活性,主要应用于PCR扩增产物的防污染。
该酶是PCR、RT-PCR及qPCR等分析方法中消除carry-over污染的理想选择。在分子诊断中,即使痕量的DNA污染也能显著降低检测灵敏度,因此,UNG酶在分子诊断领域应用非常广泛。
与其他来源UNG酶相比,Cod UNG酶具有高酶活、在温和热处理条件下(55℃)能够完全、不可逆失活等优势,能够提高PCR反应的效率及灵敏度,并能提高PCR产物的长期稳定性,便于下游应用,如克隆构建、测序等。
Cod UNG适用于常见的缓冲体系,兼容多种样本类型。Cod UNG的优异性能,使其易于使用、便于自动化操作、兼容绝大多数工作流程,如PCR、qPCR、RT-PCR等。
全能核酸酶--生物制品规模化生产解决核酸残留困扰
全能核酸酶是来自Serratia marcescens,经基因工程改造的核酸切酶。该酶能将核酸降解成2~5个碱基的5'-单磷酸核苷酸,能高效地降解任何形式(单链,双链,线状,环状)的DNA和RNA而没有蛋白裂解活性。
重组蛋白纯化或组织细胞样品蛋白提取时,全能核酸酶可以去除核酸污染,有效降低样品粘度,便于下游操作;在细胞或细菌裂解液中加入全能核酸酶,可去除粗提物中的核酸,降低溶液粘度,从而增加蛋白产量;减少存放的外周血单细胞(PBMC)的结块现象;有效去除带负电荷的核酸对双向SDS-PAGE蛋白样品的影响,改善蛋白质的分离效果,增强二维电泳分辨率;去除疫苗(蛋白质类)和病毒样品制备中的DNA污染。
无论在实验室研究还是在工业级生产的过程中,全能核酸酶是去除生物制品中所有形式DNA和RNA的一种有效工具酶。通过高效的核酸去除,可显著提升后续实验、生产的效果及产量,性能优于其他核酸去除方法。
ERA技术
ERA技术(Enzymatic Recombinase Amplification,酶促等温扩增技术)是
先达基因
公司研发的具有全球自主知识产权等温核酸扩增技术
利用抗体制药领域先进的分子设计、蛋白定向进化、核酶亲和力成熟等技术对来源于细菌, 病毒和噬菌体的DNA聚合酶、核酸内切酶等工具酶的分子结构和功能进行改造和优化
,从而建立了全新的酶促等温扩增技术。ERA技术方法可在恒定温条件下,7~10分钟即可对痕量靶DNA/RNA特异性区段扩增数亿倍,其低温适应性和灵敏度等方面均取得了重大突破。目前,该技术方法已申请了国家专利和国际专利(申请号:201910262085.3; PCT201910262085.3)。
ERA技术产品的特点:
速度快,操作简单,从样品到出结果,20分钟完成;
灵敏度高,可达1-10copies的极高检测灵敏度。
耐抑制性强,样品只需简单处理,即可直接上样反应。
等温扩增,设备要求低,最适温度为37℃-42℃恒温,降低对设备的要求,具有广泛的设备通用性。
反应与检测闭管进行,避免气溶胶污染,安全性高。
ERA提供了一种快速、准确、便捷的生物核酸检测解决方案。
原文地址:https://zhuanlan.zhihu.com/p/431684184
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