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WB包括:样品的制备,聚丙烯酰胺凝胶的配制(预制胶除外),跑电泳,转膜封闭,孵育一抗,洗膜,敷二抗,洗膜,曝光。
现在跑电泳基本可以做到背景很干净,条带也很清晰~也很少做重复实验了,一批样品就可以跑出干净的条带…
下面是一些重点关注的问题:‼️其实主要就是两点:信噪比,也就是信号强,噪音低。(背景,非特异性结合低) ‼️信号强:➡️1、蛋白样品浓度一定要足够,一般上样20-30ug,不好跑的蛋白可以到50ug,例如磷酸化蛋白。➡️2、保证蛋白质量够的同时,上样量要少,1.0-15孔的板最好不要超过12ul,1.5-15孔的板最好不要超过15ul,我一般只上6~8ul。➡️3、每个孔上样量要一致❗️如果因为调内参导至上样量有差别,那就补齐,用loading给上样少的补到一样体积。(具体操作和说明看之前的笔记,有发过)这篇:关于wb条带宽窄不一如何解决?
➡️4、可以试试先10v跑15min,再开始85v跑上层,130v跑下层。(预制无需考虑这个问题)➡️5、转膜小分子蛋白用0.22的膜,理论上1kd 1min,比理论上再多10min即可,恒压90v或恒流300mA都可以。➡️6、敷一抗:两张膜可以背靠背孵育,如果抗体量大的话敷的很均匀,抗体量小不建议背靠背孵育。
ps :一抗的选择很重要❗️如果不知道选择什么牌子的一抗就去查CiteAb这个很好用~或者别的查抗体网页,之前我也出过合集以及教如何使用,可以自行搜一下。 ‼️噪音低:➡️1、封闭时间要够,脱脂奶粉1h起步,冬天到了起码1.5h,不要用析出的奶粉,磷酸化蛋白用BSA或者快封封闭,封闭完空洗膜10min再敷一抗!会干净很多。➡️2、洗膜的时候一抗可以洗久一点,非特异性结合很多时候都在一抗结合时期,二抗正常洗,另外,一抗4度过夜孵育比常温孵育效果好,4度孵育最好超过9个小时。➡️3、二抗常温孵育1h即可,冬天1.5h,不好孵育的蛋白可适当延长时间。➡️4、曝光,一定要选择好用的发光液,如果信号很强,建议稀释发光液,用1*TBS稀释就行~太强有时候反而会掩盖趋势。
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