| 这并不是标题党，而是正儿八经的GenomeWeb的采访。最近，加拿大圭尔夫大学（University of Guelph）的研究人员评估了来自中国齐碳科技的纳米孔测序仪。研究人员将齐碳科技的通量较低的QNome-3841平台与牛津纳米孔技术公司的MinION设备进行了比较，重点关注靶向扩增子测序。研究人员总结称，总体而言，在DNA条形码应用方面，齐碳的QNome-3841被证明是ONT MinION的"有效替代品"。例如，在第一个实验中，MinION flowcell为8,159个样本生成了有效barcode，而齐碳的flowcell产生了8,076个。在第二个实验中，Flongle flowcell为2,207个样本生成了有效barcode，而QCell的对应数字为2,157个。主导本次研究的汤普森说"几乎所有我们从牛津纳米孔获得有效序列的样本，齐碳也同样获得了"。不过，与MinION 相比，QNome平台也有其缺点。研究人员指出，一方面，使用齐碳平台生成的共有序列"始终"比牛津纳米孔平台有更多模糊碱基，表明读取准确性较低。这说的是实话，目前齐碳QNome作为该公司早期产品，准确性是尚待提高。另外一个挑战是齐碳测序仪的高GC区域测序模糊碱基出现的比率要高于ONT，不过在低GC区域则差异不大。汤普森解释说，鉴于节肢动物的线粒体DNA通常GC含量较低，这项研究为齐碳平台提供了"非常有利的条件"，而对牛津纳米孔平台则是最不利的情况，后者在富含AT的区域表现更困难。至于为什么研究人员要测试中国的纳米孔测序仪，这位研究人员的回答也非常直白。起因是牛津纳米孔去年宣布计划停用Flongle—其通量最低、最便宜的flowcell。研究人员在论文中指出，使用Flongle flowcell（产生2.8 Gb数据）进行一次典型的MinIon运行成本约为210美元。而使用标准MinION flowcell（产生48 Gb数据）的成本为960美元。相比之下，使用QCell flowcell进行一次QNome运行可产生9 Gb数据，成本为280美元。平均下来Flongle、MinION、QNome的平均每G成本分别为75、20和30美元。不过...QNome还可以多次复用，而Flongle只能单次使用。"当我们看到报价时，我们立刻就想买，"汤普森说。"这简直不用犹豫。"如果，我告诉他齐碳还有一个QPursue-6k单芯片重复清洗42 次，测序43 次的记录不知道会不会直接馋哭。所以朋友们，有的时候大家自信点，咱们国产的科学工具绝对是可以的。没事，以后老外会更多的感受到中国测序仪、蛋白组等科研工具的威力的。就说纳米孔测序仪吧，我们除了齐碳还有华大智造的CycloneSeq、普译的PloySeq、梅丽的MerrySeq。而且我们还不仅仅只有这一条技术路线，我们还有纳米孔边合成边测序的今是、安序源。
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