Karius的呼吸道mNGS（宏基因组高通量测序）产品，名称是Karius Focus™ | BAL（后续简称“Focus”）- 直译：专注于支气管肺泡灌洗液（bronchoalveolar lavage fluid，BALF）样本的mNGS检测产品。
与国内mNGS产品兼容绝大多数样本不同的是，Focus只检测肺泡灌洗液样本，甚至不适用于其他呼吸道样本，比如痰液、气道抽吸物等为了快速的了解Focus产品如何，直接对比国内mNGS产品：除了样本类型局限BALF，样本量跟国内mNGS是一致的检测周期：周一至周六上午8:30前收到的样本，次日出报告从实际临床应用来看，上午8:30分之前样本几乎都是前一天的因此，按照国内mNGS的运行标准，可以认为Focus是收到样本之后48小时内出报告。诊断性能：相较于常规病原学检测方法，诊断率提升50%以上- 这个结论是基于Karius未发表的内部数据，采用Karius Focus BAL检测明确判定了40例患者的肺炎病因，而使用常规病原学检测的对照组仅判定出28例。“非公开”、“40例”、“28例”，这些内容无疑都提示：Focus诊断性能的数据，样本数量偏少，结论也有点糙。初步来看，不管Karius于2019年在Nature microbiology对Karius Spectrum产品性能确认的研究成果，还是多数的国内mNGS临床应用价值评估，纳入评估的样本数量都远多于这个。
截止到这里，整体上来说，Focus的产品性能也还算说得过去。按照产品介绍内容信息，Focus可检测病原体数量共计500+种（没有具体的数值，获取的病原体列表来看，521种），包含350+种细菌、15+种DNA病毒、115+种真菌、30+种寄生虫。- 乍一看病原体数量，几乎跟国内呼吸道tNGS检测范围相当。
- 再一看，可能还不如呼吸道tNGS，Focus既没有耐药基因，也没有毒力基因。
是的，适用于疑似肺部感染患者检测的Focus病原体列表中，居然没有RNA病毒2021年，中国疾病预防控制中心在Nature communications发布了一项历时11年的呼吸道传染病监测数据来看，有34.8%的急性呼吸道感染患者至少感染一种病毒且呈阳性，其中多数是RNA病毒。以下病毒性呼吸道感染的病原体谱的阳性率占比（%）RSV：呼吸道合胞病毒（RNA病毒） HRV：鼻病毒（RNA病毒） HPIV：副流感病毒（RNA病毒） HAdV：腺病毒（DNA病毒） HCoV：冠状病毒（RNA病毒） HBoV：博卡病毒（DNA病毒） HMPV：偏肺病毒（RNA病毒） 2015年，新英格兰医学杂志发表的同时期美国成人/儿童社区获得性肺炎（community-acquired pneumonia，CAP）的多中心调查发现：- 美国成人住院CAP患者病毒检出率为23%，其中TOP5都是RNA病毒：鼻病毒、流感病毒、人偏肺病毒、呼吸道合胞病毒与副流感病毒
- 美国儿童住院CAP患者中呼吸道合胞病毒（RSV）、鼻病毒（HRV）、人偏肺病毒（HMPV）、副流感病毒（PIV）与冠状病毒（CoV）等RNA病毒都占据重要地位的病原体
因此，不管中国还是美国的研究成果都表明一点：明确RNA病毒对肺部感染的诊疗至关重要回顾Focus的检测流程，只做了DNA流程，并没有RNA流程那为什么Karius不做RNA流程呢？是技术原因？还是出于临床应用的考虑？带着这个思考，我们再细看Focus产品在参考值与临床价值部分引用的文章。这是一篇2024年发表在《Clinical Infectious Diseases》关于“血浆微生物游离DNA测序在免疫功能低下患者肺炎诊断的价值评估研究”的文章。两个关键词：“肺炎诊断”、“血浆微生物游离DNA测序”也就是说，该研究成果面向的是免疫功能低下肺部感染患者，但采用的血浆样本（即Karius Spectrum产品），而不是肺泡灌洗液样本即：作为支持Focus产品性能的研究成果，并不是Focus检测的Focus产品或许没有那么充分的临床研究证据来支持，再回头看“诊断性能”部分，样本数量偏少的数据似乎也就合理了。我们再次回顾性总结一下Karius Focus™ | BAL产品- 样本类型：仅限于肺泡灌洗液样本（呼吸道其他样本类型也不行）。
- 检测周期：收到样本之后次日出报告，实际上需要48小时。
- 检测范围：500+种病原体，没有RNA病毒，没有耐药基因，没有毒力基因。
再对比当前国内病原NGS（含mNGS与tNGS）赛道中优秀的玩家们。
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