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赛沛呼吸道四联分子检测获批!来看看这款产品究竟怎么样

2025-6-27 11:40| 编辑: 归去来兮| 查看: 345| 评论: 0

摘要: 本文将深入解读该案例,提炼出对企业注册申报有借鉴意义的关键要素。

近日,美国FDA批准了Cepheid公司的Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus测试的510(k)申请,该测试可在GeneXpert Xpress系统上用于同时定性检测和区分SARS-CoV-2、甲流、乙流和呼吸道合胞病毒(RSV)的病毒RNA。


这一批准不仅是Cepheid产品线的扩展,也为其他分子诊断企业提供了宝贵的注册申报参考。


本文将深入解读该案例,提炼出对企业注册申报有借鉴意义的关键要素。


产品背景与技术平台


Cepheid的Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus是一种多重实时逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测,用于定性检测和区分SARS-CoV-2、甲流、乙流和RSV的病毒RNA。


该测试在GeneXpert Xpress系统上运行,具有高度自动化和快速检测的特点,从样本处理到结果报告可在约36分钟内完成。


Cepheid选择的技术平台是实时RT-PCR,这是一种成熟且被广泛认可的分子诊断技术,能够在短时间内提供高灵敏度和高特异性的检测结果。


这种技术平台的选择不仅确保了检测的准确性,还提高了检测效率,满足了临床对快速诊断的需求。


适应症与预期用途


Cepheid公司的Xpert Xpress CoV - 2/Flu/RSV plus检测产品有着明确的预期用途和适用情况。


该检测是在GeneXpert Xpress系统上进行的自动化多重实时逆转录聚合酶链反应(RT - PCR)检测。


其预期用途主要是用于定性检测和区分来自有呼吸道感染症状个体的鼻咽拭子和前鼻拭子样本中的严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS - CoV - 2)、甲流、乙流和呼吸道合胞病毒(RSV)的病毒RNA。


因为由这些病毒引起的呼吸道感染临床症状可能相似,所以这个检测有助于对COVID - 19、流感和/或RSV感染进行诊断,不过需要结合其他临床、流行病学信息和实验室检查结果。


在检测结果的解读方面,阳性结果表明存在所检测到的病毒,但不能排除细菌感染或者未被该检测发现的其他病原体的合并感染,并且检测到的病原体可能不是疾病的确切病因。


阴性结果也不能排除SARS - CoV - 2、甲流病毒、乙流病毒和/或RSV感染,所以这个检测结果不能作为治疗或其他患者管理决策的唯一依据。


此外,该检测仅供处方使用,仅用于体外诊断。并且需要特定的仪器GeneXpert Xpress System来进行检测。


产品特征


Cepheid公司的Xpert Xpress CoV - 2/Flu/RSV plus检测系统在设备特性方面有着诸多特点。


3.1  设备描述


这个检测是在GeneXpert Xpress系统上开展的自动化体外诊断测试,用于对有呼吸道病毒感染症状个体的鼻咽拭子和前鼻拭子样本中的SARS - CoV - 2、甲流、乙流和RSV病毒RNA进行定性检测与区分。


检测过程包含三个步骤,即使用移液管将液体样本转移到测试卡盒、在GeneXpert Xpress系统上运行检测以及读取结果。


GeneXpert Xpress系统的Hub配置包括GeneXpert IV仪器、集成条形码扫描仪以及带有触摸屏和预装测试运行与结果查看软件的计算机。


该系统使用一次性卡盒,卡盒内包含RT - PCR试剂,可进行样本纯化、核酸扩增和目标序列检测。


Xpert Xpress CoV - 2/Flu/RSV plus测试卡盒涵盖了检测所需的所有试剂,这些试剂用于检测用尼龙植绒拭子采集并置于3 mL病毒运输培养基(VTM)/通用运输培养基(UTM)或2 mL eNAT中的鼻咽拭子和前鼻拭子样本中的病毒RNA。


通过提供的移液管将洗脱后的样本加载到一次性自含式测试卡盒的样本室中。


每个卡盒都有独立的样本加载、样本处理和实时RT - PCR目标扩增腔室,并且包含开展这些过程所需的所有试剂。


检测中的引物和探针设计用于扩增和检测特定基因序列,如SARS - CoV - 2的包膜小膜蛋白[E]、核衣壳蛋白[N2]序列和RNA依赖的RNA聚合酶[RdRP],甲流的基质蛋白基因[MP]、病毒聚合酶复合体的基本聚合酶蛋白[PB2]和酸性蛋白[PA]基因,乙流的基质蛋白基因和非结构蛋白[NS]基因,以及RSV A和B的核衣壳基因片段。


卡盒中还包含样本处理对照(SPC)和探针检查对照(PCC),SPC用于控制样本处理情况、监测RT - PCR反应中的潜在抑制物并确保反应条件和试剂正常工作,PCC用于验证试剂再水合、PCR管填充情况以及反应组分的完整性等。


由于卡盒是自含式的,样本不会接触仪器模块的工作部件,从而最大程度减少了样本间的交叉污染。


测试卡盒加载到四个可随机访问的GeneXpert仪器模块之一后,大约36分钟就能完成全自动且集成的样本制备和实时RT - PCR检测。


该检测有五种运行模式,包括仅检测SARS - CoV - 2、检测SARS - CoV - 2和流感、检测SARS - CoV - 2/流感/RSV、仅检测流感以及检测流感和RSV,并且在仅检测SARS - CoV - 2和仅检测流感模式下可选择早期检测终止(EAT)功能,在高滴度样本中若目标核酸信号在检测完成前达到预定阈值可提前得到结果,激活EAT功能时最早约25分钟可得到阳性结果。


检测完成后,GeneXpert软件会根据测量的荧光信号和内置计算算法解读结果并显示在“查看结果”窗口。


3.2  操作原理


这个检测是基于核酸的实时RT - PCR检测。


将样本添加到测试卡盒的样本室后,把卡盒加载到GeneXpert Xpress系统平台上,仪器就会自动进行样本处理,包括RNA提取、逆转录、扩增、检测以及结果报告,结果由系统自动解读并显示在查看结果窗口。


3.3  仪器描述


仪器名为GeneXpert Xpress System。


3.4  样本标识


样本ID用于将处理的样本与提供样本的患者相关联,可通过扫描条形码、手动输入或让系统随机分配等方式进入系统。


进行检测时,用户从主屏幕选择“NEW TEST”图标,根据管理员配置情况可能需要输入患者信息或进入样本ID屏幕,之后扫描卡盒条形码并选择要运行的检测,将准备好的测试卡盒加载到有闪烁绿灯的可用仪器模块以启动检测。


3.5  样本采样和处理


测试卡盒包含检测鼻咽拭子或前鼻拭子样本中病毒RNA的试剂,样本采集使用尼龙植绒拭子并洗脱到含有VTM/UTM或eNAT的运输管中,在检测机构,操作人员需快速颠倒采集管5次混匀样本,然后用提供的移液管将样本转移至测试卡盒样本室,关闭卡盒盖后加载到仪器上进行自动化检测。


3.6  校准


GeneXpert Xpress仪器的校准在工厂进行,初始系统启动时客户现场不需要重新校准,具有管理员用户权限的操作员或现场服务工程师可在年度维护期间进行校准检查。


3.7  质量控制


系统依靠每个测试卡盒内置的内部对照来确保测试系统正常运行,包括SPC和PCC。


SPC是一种非传染性装甲RNA假病毒,可确保样本处理得当并监测RT - PCR反应中的潜在抑制物,其在所有目标分析物阴性的样本中应为阳性,在含有可检测到的一种或多种目标分析物的样本中可为阴性或阳性。


PCC用于控制试剂再水合等情况,若PCC的任何条件未通过验证接受标准,结果将报告为无结果 - 重复测试,必须使用新的测试卡盒重新检测。


虽然终端用户不需要外部对照来获得有效的检测结果,但有可选的外部质量控制材料可供使用,并且推荐按照制造商的说明在特定情况下进行外部对照检测,如每次接收新批次的测试试剂盒、每次接收新的试剂盒运输批次、每次新操作人员检测、怀疑或发现存在问题以及机构标准质量控制程序要求时等。


实质等同性分析


本次实质等同性分析主要围绕Cepheid公司新一代检测系统Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus展开,该系统与已获FDA批准的同类产品Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus(原GeneXpert Instrument Systems版本)进行全面对比评估。


4.1  监管分类


两款设备同属21 CFR 866.3981类别,即用于检测和鉴定呼吸道样本中导至SARS-CoV-2感染及其他微生物的核酸靶标设备,产品代码均为QOF。


这一分类表明两款设备在监管框架下具有完全相同的产品定位和管理要求。


4.2  技术原理


新旧两代系统都采用实时逆转录聚合酶链反应(RT-qPCR)技术,这是目前分子诊断领域公认的黄金标准技术。


这种技术路线的一致性确保了检测方法学上的高度可比性,为实质等同性奠定了坚实基础。


4.3  预期用途


两款设备的设计理念完全一致,都是用于对有呼吸道感染症状个体的鼻咽拭子和前鼻拭子样本进行多重核酸检测。


它们都能同时检测SARS-CoV-2、甲流、乙流和RSV四种病毒,且都强调检测结果需结合临床和其他实验室数据进行综合判断。


这种临床应用定位的完全一致,确保了新一代系统能够无缝衔接现有的临床工作流程。


4.4  检测性能参数


两款设备在多个关键指标上保持完全一致:


  • 检测靶标完全相同,都针对四种呼吸道病毒的核酸序列;

  • 可接受的样本类型完全一致,包括鼻咽拭子和前鼻拭子;

  • 运输介质要求相同,都支持UTM/VTM和eNAT两种常用运输介质;

  • 检测格式均为一次性使用设计;

  • 自动化程度相同,都实现从核酸提取到结果解读的全自动化流程。


特别值得注意的是,新一代系统在保持所有核心功能不变的基础上,对软件操作界面进行了优化升级。


虽然检测结果的解读方式(定性结果)和可能出现的非确定性结果提示文本(如“NO RESULT REPEAT TEST”等)完全一致,但新系统增加了视频指导功能,使操作更加直观便捷。


这种改进虽然提升了用户体验,但并未改变设备的基本性能特征。


在质控体系方面,两款设备都采用相同的内部对照系统,包括样本处理对照(SPC)和探针检查对照(PCC),确保检测过程的可靠性和结果的准确性。


仪器系统虽然从GeneXpert Dx和Infinity升级到Xpress系统,但配套软件(GeneXpert Xpress software)在核心算法和功能上与前代产品保持一致,保证了检测结果的可比性。


最关键的检测时间指标也完全一致,两款设备都能在36分钟内完成从样本处理到RT-PCR检测的全过程。


这一时间效率的保持对于临床快速诊断至关重要,特别是在呼吸道感染高发季节,能够确保患者得到及时诊治。


性能特征


5.1  分析性能


5.1.1  精密度/重现性


研究分为实验室内部精密度和跨实验室重现性两个部分,采用严谨的实验设计和大量的测试数据,确保评估结果的可靠性。


在实验室内部精密度评估中,研究人员使用了687个测试结果(包括654个样本和33个对照样本),这些数据全部来自GeneXpert Xpress软件版本6.4a的分析结果。


通过与先前研究(K231481)的数据对比发现,新一代检测系统在所有测试案例中都表现出完全一致的结果。


这一发现充分证明了Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus检测系统在相同实验条件下具有高度稳定的检测性能。


更具挑战性的重现性研究则是在多中心、多操作者、多仪器环境下进行的盲法实验。



研究设计了两个模拟样本组,分别代表低阳性样本(约1.5倍检测限水平)和中度阳性样本(约3倍检测限水平)。


每个样本组包含5个成员,分别针对SARS-CoV-2、甲流、乙流、RSV四种病毒以及阴性对照。


实验在三个独立的CLIA豁免实验室进行,每个实验室由三名操作者分别在不同日期完成测试。


每位操作者在五个工作日内每天进行一次测试,每次测试包含两个重复样本。



研究结果显示,在90个低阳性样本测试中,除甲流和乙流各有一个样本出现非确定性结果外(最终通过重复测试获得正确结果),其他所有样本均获得了与预期完全一致的结果。


在90个中度阳性样本测试中,所有样本都获得了100%一致的检测结果,综合所有测试数据,整个研究获得了97.8%的一致率。


5.1.2  分析特异性/干扰


研究采用了湿实验和生物信息学分析相结合的方法,并通过软件升级后的数据再分析,确保评估结果的可靠性。


5.1.2.1  包容性


研究人员对726个测试结果进行了软件升级后的再分析。


虽然有17个非确定性结果保持不变,但所有709个有效结果都与之前完全一致。


特别值得注意的是,软件升级后对错误信息的分类进行了优化,使结果解读更加清晰。


这一再分析过程充分证明了检测系统在识别目标病毒方面的稳定性,能够准确检测包括SARS-CoV-2、甲流、乙流和RSV在内的多种呼吸道病毒。


针对SARS-CoV-2的生物信息学分析,研究人员通过计算机模拟方法验证了检测系统对不同SARS-CoV-2变异株的识别能力。


5.1.2.2  交叉反应


研究人员测试了检测系统对其他非目标微生物的反应情况。


36个测试样本在软件升级后全部给出了与之前一致的结果,没有出现非确定性结果。


这表明检测系统具有良好的特异性,不会将其他呼吸道微生物误判为目标病毒,这对于避免假阳性结果至关重要。


5.1.2.3  干扰


微生物干扰测试评估了临床样本中可能存在的其他微生物对检测结果的影响。


442个测试样本中有440个给出了有效结果,虽然有两个“无结果”信息被重新归类为“需重复测试”,但所有有效结果都与之前完全一致。


这一结果表明,即使在样本中存在其他微生物的情况下,检测系统仍能可靠地检测目标病毒,最大限度地减少了临床样本复杂性对检测结果的影响。


竞争性干扰测试则评估了当样本中存在多种病毒时,检测系统能否准确识别每种病毒。


84个测试样本全部给出了与之前一致的有效结果,没有出现任何非确定性结果。


这一发现对于临床诊断尤为重要,因为在实际感染中,患者可能同时感染多种呼吸道病毒,检测系统需要能够准确识别每一种病原体。


最后,研究人员评估了各种潜在干扰物质对检测结果的影响。


2571个测试样本中有2533个给出了有效结果,虽然有38个非确定性结果,但所有有效结果都与之前完全一致。


这些潜在干扰物质可能包括药物、代谢产物或其他存在于临床样本中的物质。


尽管存在一定比例的非确定性结果,但有效结果的一致性表明,检测系统在大多数情况下能够抵抗这些干扰物质的影响,提供可靠的检测结果。


5.1.3  溯源、稳定性和预期值


本次评估全面验证了Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus检测系统在溯源性、样本稳定性以及试剂盒保存时间等方面的性能表现。


5.1.3.1  质控品


研究人员对121个测试结果进行了软件升级后的再分析。


结果显示,所有120个有效结果都与之前完全一致,仅有一个非确定性结果保持不变。


虽然有一个“ERROR”信息被重新归类为“需重复测试”,但这一调整并不影响整体评估结果。


5.1.3.2  样本稳定性


研究涵盖了多种临床样本保存条件和时间。


对于保存在UTM/VTM运输介质中的鼻咽拭子(NPS)样本,277个测试结果显示,在2-8 ℃条件下可保存长达7天,在室温(15-30 ℃)条件下可保存48小时。


虽然有一个“NO RESULT”信息被重新归类为“需重复测试”,但所有有效结果都保持一致。


这一发现为临床实验室提供了明确的样本保存指南,确保了样本在运输和储存过程中的可靠性。


对于保存在eNAT介质中的鼻咽拭子样本,278个测试结果表明,在2-8 ℃条件下可保存6天,在室温条件下可保存48小时。


尽管有两个“ERROR”信息保持不变,但所有有效结果都完全一致。


这一结果进一步扩展了样本保存的选择性,使实验室可以根据实际情况选择最适合的运输介质。


特别值得注意的是,研究还评估了样本在-80 ℃和-20 ℃条件下的冻融稳定性。


在-80 ℃条件下进行的377个测试显示,样本可承受一次冻融循环,尽管有七个“ERROR”和十个“INVALID”信息保持不变,但所有有效结果都保持一致。


在-20 ℃条件下的368个测试也得出类似结论,样本可承受一次冻融循环,四个“NO RESULT”和四个“ERROR”信息保持不变,但所有有效结果都完全一致。


这些发现对于需要长途运输或在特殊情况下储存样本的实验室尤为重要,确保了样本在冻融过程中的稳定性。


5.1.3.3  开封稳定性


在试剂盒保存时间方面,256个测试结果显示,制备好的检测卡盒可在室温下保存4.5小时而不影响检测结果。


所有有效结果都完全一致,没有出现非确定性结果。


5.1.4  检测限


研究采用了两步验证法,并使用不同批次的试剂进行测试,确保了结果的可靠性和重复性。


在临床鼻咽拭子(UTM/VTM基质)的检测限研究中,研究人员首先对2927个测试结果进行了软件升级后的再分析。



结果显示,所有2900个有效结果都与之前完全一致,仅有的27个非确定性结果保持不变。


虽然部分错误信息被重新分类,但这一调整并不影响整体评估结果。


随后进行的586个验证测试也显示出完全一致的结果,进一步确认了检测系统在鼻咽拭子样本中的检测限表现。


在临床前鼻拭子(UTM/VTM基质)的检测限研究中,同样采用了两步验证法。


3064个初始测试结果显示出良好的重复性,所有3040个有效结果都与之前一致,非确定性结果数量保持不变,后续765个验证测试也获得了完全一致的结果。



研究数据表明,前鼻拭子样本的检测限略高于鼻咽拭子,这可能与样本采集方式和病毒载量分布有关。


例如,对于SARS-CoV-2的USA-WA1/2020株,两个试剂批次在前鼻拭子中的检测限分别为50拷贝/mL和64拷贝/mL,平均Ct值为40.0-40.4。


5.1.5  携带污染


研究采用了85个测试样本进行携带污染分析,在软件升级后对这些样本进行了再分析。


结果显示,82个有效结果与之前完全一致,仅有3个非确定性结果保持不变。


虽然错误信息的分类有所调整——将一个“NO RESULT”信息改为“需重复测试”,两个“ERROR”信息也调整为“需重复测试”——但这些调整并不影响整体评估结论。


这一结果充分证明了检测系统在防止样本间交叉污染方面的有效性。


5.1.6  基质效应


本次评估全面验证了Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus检测系统在不同样本基质中的性能一致性,包括临床样本与模拟样本的比较,以及不同运输介质间的比较。


研究通过大量实验数据证实了该检测系统在多种临床应用场景下的可靠性和适应性。


在临床鼻咽拭子(UTM/VTM基质)、临床前鼻拭子(UTM/VTM基质)与模拟拭子(UTM/VTM基质)的比较研究中,研究人员对938个测试样本进行了软件升级后的再分析。


结果显示,所有930个有效结果都与之前完全一致,仅有的8个非确定性结果保持不变。虽然部分错误信息未被修改,但这并不影响整体评估结论。


在临床鼻咽拭子(UTM/VTM基质)与临床鼻咽拭子(eNAT基质)的比较研究中,625个测试样本的再分析结果显示,所有620个有效结果都与之前完全一致,非确定性结果数量也保持不变。


虽然部分错误信息分类未被调整,但所有有效结果的一致性证明了检测系统在使用不同运输介质时的稳定性。


5.2  临床研究


5.2.1  前瞻性临床研究


研究采用多中心设计,覆盖美国23个地理位置不同的临床站点,纳入了具有呼吸道感染症状的真实患者样本,为检测系统的临床应用提供了坚实的证据基础。


研究在美国23个临床站点开展,其中22个站点负责使用GeneXpert Xpress系统进行检测和样本采集,1个站点专门负责对比检测和结果不一致的调查工作。


这种分工明确的多中心设计确保了研究数据的全面性和可靠性。


研究人员在2022年1月24日至2022年7月19日期间,前瞻性地收集了来自有呼吸道病毒感染症状患者的新鲜(一类样本)和冷冻(二类样本)鼻咽拭子(NPS)及前鼻拭子(ANS)样本,这些样本均保存在UTM/VTM运输介质中。


此外,研究还纳入了2016-2017年流感季节期间收集的二类样本,用于专门评估检测系统对甲流、乙流和RSV三种病原体的检测性能。


5.2.2  样本纳入与评估


这项前瞻性临床研究全面评估了Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus检测系统在实际临床应用中的性能表现,研究设计严谨,样本纳入过程规范,为检测系统的临床应用提供了可靠的数据支持。


研究在美国23个地理位置不同的临床站点开展,共纳入了5166名有呼吸道感染症状的受试者,评估检测系统对SARS-CoV-2、甲流、乙流和RSV四种病原体的检测性能。



研究采用“全纳入”方式收集样本,不设特定排除标准,确保研究人群能够真实反映临床实际情况。


样本类型包括鼻咽拭子(NPS)和前鼻拭子(ANS),采集后保存在UTM/VTM运输介质中,既有新鲜样本(一类样本)也有冷冻样本(二类样本),以全面评估检测系统在不同样本条件下的性能表现。


在样本筛选过程中,研究人员严格执行纳入和排除标准。


对于SARS-CoV-2检测性能评估部分,最初纳入3807名受试者,经过一系列严格的筛选程序后,最终3147份样本(1565份NPS和1582份ANS)符合评估标准。


筛选过程包括排除未提供样本的参与者、不符合纳入/排除标准的样本、知情同意文件有问题的样本、违反研究方案的样本以及对比检测结果不可靠的样本。


特别值得注意的是,研究人员特别关注了检测结果的重复性和可比性,排除了那些无法获得明确结果的样本,确保最终用于评估的样本质量可靠。


对于甲流、乙流和RSV检测性能评估部分,最初纳入5166名受试者,经过类似的严格筛选程序后,最终4310份样本(2175份NPS和2135份ANS)符合评估标准。


研究人员同样严格执行各项排除标准,确保最终评估样本的质量和代表性。


研究还详细收集了受试者的基本人口学信息,包括性别、年龄、种族、民族和COVID-19疫苗接种状态等。


数据显示,在4561份可用于评估的样本中,女性略多于男性(58.5% vs 41.5%),年龄分布以22-59岁年龄段为主(47.0%),种族构成以黑人和白人为主,2022年采集的样本中约54.3%的受试者已完成COVID-19疫苗接种。


这些详细的基线数据为后续分析检测结果与患者特征之间的关系提供了基础。


在评估方法上,研究人员采用了金标准对比法。


对于SARS-CoV-2检测性能评估,使用美国FDA批准的包含SARS-CoV-2检测的分子呼吸道检测组合作为对比方法。


对于甲流、乙流和RSV检测性能评估,则使用美国FDA批准的分子Flu A/B/RSV检测作为对比方法。


采用阳性符合率(PPA)和阴性符合率(NPA)作为主要评价指标,计算方法科学严谨。


对于结果不一致的样本,研究人员采用了额外的确认性检测,包括使用美国FDA紧急使用授权(EUA)的SARS-CoV-2分子检测或FDA批准的分子呼吸道检测组合进行复测,确保结果判断的准确性。


5.2.3  临床研究结果分析


这项前瞻性临床研究全面评估了Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus检测系统在实际临床应用中对SARS-CoV-2、甲流、乙流和RSV四种呼吸道病原体的检测性能。


研究通过大量真实临床样本的检测,验证了该检测系统在不同样本类型和保存条件下的准确性和可靠性。


在鼻咽拭子(NPS)样本的检测中,研究人员共分析了1565份样本的SARS-CoV-2检测性能和2175份样本的甲流、乙流和RSV检测性能。



结果显示,对于SARS-CoV-2检测,新鲜样本(一类样本)的阳性符合率(PPA)达到98.7%,阴性符合率(NPA)为98.5%。冷冻样本(二类样本)虽然样本量较小,但也表现出100%的PPA。


综合来看,NPS样本的整体PPA为98.7%,NPA为98.5%;在流感病毒检测方面,甲流的PPA高达99.1%,NPA为98.5%;乙流的PPA为96.6%,NPA达到99.9%;RSV的PPA为97.8%,NPA更是高达100%。


这些数据表明,Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus检测系统在鼻咽拭子样本中具有优异的检测性能,能够准确识别各种呼吸道病原体。


特别值得注意的是,研究人员对检测结果不一致的样本进行了额外的确认性检测,包括使用美国FDA紧急使用授权(EUA)的SARS-CoV-2分子检测或FDA批准的分子呼吸道检测组合进行复测,确保了结果判断的准确性。


在前鼻拭子(ANS)样本的检测中,研究人员分析了1582份样本的SARS-CoV-2检测性能和2135份样本的甲流、乙流和RSV检测性能。



结果显示,对于SARS-CoV-2检测,所有样本均为新鲜样本(一类样本),PPA为98.4%,NPA为98.7%。


在流感病毒检测方面,甲流的PPA为96.4%,NPA为99.4%;乙流的PPA高达100%,NPA为99.6%;RSV的PPA为97.6%,NPA达到99.9%。


这些结果同样表明,Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus检测系统在前鼻拭子样本中也具有出色的检测性能。


5.2.4  非确定性结果率分析


非确定性结果是指检测系统无法给出明确阳性或阴性判断的情况,这类结果需要特别关注,因为它们可能影响临床决策的及时性和准确性。


研究数据显示,在最初的分析中,2022年和2016-2017年收集的所有前瞻性样本(包括一类新鲜样本和二类冷冻样本)的总体非确定性结果率为2.7%(123/4561)。


这一比例在经过重复检测后显著降低至0.6%(26/4561),表明初次检测中出现的大多数非确定性结果可以通过重复检测得到明确判断。


这种显著改善说明检测系统本身具有较高的可靠性,初次检测中的非确定性结果往往是由于技术性原因而非样本本身的问题。


具体到不同样本类型,鼻咽拭子(NPS)样本的初始非确定性结果率为2.5%(58/2300),经过重复检测后降至0.3%(7/2300)。


前鼻拭子(ANS)样本的初始非确定性结果率为2.9%(65/2261),重复检测后降至0.8%(19/2261)。


在样本保存状态方面,新鲜样本(一类样本)的初始非确定性结果率为2.7%(90/3333),重复检测后降至0.5%(18/3333)。


冷冻样本(二类样本)的初始非确定性结果率为2.7%(33/1228),重复检测后降至0.7%(8/1228)。


数据显示,新鲜样本和冷冻样本在初次检测时表现出相似的非确定性结果率,但冷冻样本在重复检测后的改善幅度略小于新鲜样本。


5.2.5  多靶标检测性能分析


研究人员对2022年收集的3028份前瞻性样本进行了全面分析,这些样本同时使用Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus检测系统和对比检测方法进行检测。



结果显示,在SARS-CoV-2检测方面,Xpert系统的阳性检出情况与对比方法基本一致,但在共感染检测方面存在一些差异。


特别值得注意的是,Xpert系统检测到的共感染率为0.1%(1/797),而对比方法的共感染率为0.3%(2/774)。


在这有限的共感染案例中,有一个病例的检测结果在两种方法之间存在不一致,这提示临床实验室在遇到共感染情况时可能需要特别关注检测结果的解读。


研究还纳入了2022年和2016-2017年收集的4310份样本,专门评估甲流、乙流和RSV的检测性能。



数据显示,Xpert系统在这三种病毒的共感染检测方面表现出更高的敏感性,共感染率达到2.04%(15/737),而对比方法的共感染率为1.29%(9/698)。


在总共检测到的17例共感染病例中,有10例在两种检测方法之间存在不一致,这一比例明显高于SARS-CoV-2检测中的差异率。


这种差异可能与不同病原体的流行特点、病毒载量分布以及检测方法的灵敏度差异有关。


5.3  预期值/参考范围


在2022年的研究中,共对3147份样本进行了检测,这些样本包括鼻咽拭子和鼻拭子两种类型。



结果显示,新冠病毒的阳性率达到了19.9%,显示出该病毒在当时仍然具有较高的传播率。在不同年龄组中,60岁及以上人群的感染率最高,达到了22.8%,而5岁以下儿童的感染率相对较低,为12.5%。


甲流型的阳性率为6.2%,在6至21岁年龄组中的感染率最高,达到了10.3%。值得注意的是,乙流型和RSV的阳性率非常低,分别为0%和0.4%,几乎可以忽略不计。


对比2016-2017年流感季的数据,当时共检测了1124份样本。



由于这一时期新冠疫情尚未暴发,新冠病毒的检测结果不适用。然而,甲流型和RSV的感染情况却非常显著。


甲流型的阳性率高达23.9%,尤其在22至59岁年龄组中,感染率达到了42.0%。


乙流型的阳性率为8.5%,在5岁以下儿童中的感染率为7.3%。


RSV的阳性率为15.8%,在5岁以下儿童中的感染率更是高达33.1%,显示出该病毒对婴幼儿群体的显著影响。


从样本类型来看,无论是鼻咽拭子还是鼻拭子,检测结果的阳性率差异不大。


三个关键问题


好,和之前一样,最后我用三个关键问题把这份审评报告的相关内容串联起来。


第一个问题,Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus测试在临床样本中的具体检测目标是什么?


Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus测试的开发目的是实现对四种常见呼吸道病毒RNA的同步定性与区分检测。


这项检测技术能够精准识别每种病毒特有的保守RNA序列区域。


在针对SARS-CoV-2病毒的检测中,系统会特异性地靶向其核衣壳蛋白(E)、核壳蛋白(N2)以及RNA依赖的RNA聚合酶(RdRP)等关键保守序列。


对于流感A病毒,检测重点集中在基质蛋白(M)、基本聚合酶蛋白2(PB2)和酸性蛋白(PA)这些具有高度保守性的RNA区域。


当检测流感B病毒时,系统主要识别基质蛋白(M)和非结构蛋白(NS)的保守序列。


而对于呼吸道合胞病毒(RSV),检测则针对其核衣壳蛋白这一特征性保守序列进行特异性识别。


这种多重靶向检测设计使得该测试能够准确区分四种不同的呼吸道病毒,为临床诊断提供可靠依据。


第二个问题,Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus测试的样本处理和检测流程是怎样的?


该检测系统的样本处理与检测流程设计严谨且自动化程度高。


整个过程始于样本转移环节,操作人员需使用系统配套的专用转移吸头,将采集到的样本液体精确转移至检测卡盒中。


完成样本转移后,检测卡盒会被装载到GeneXpert Xpress检测系统上,此时系统会自动完成一系列复杂的检测步骤:首先是样本处理,接着进行RNA提取,随后是逆转录反应,紧接着是核酸扩增,最后生成并报告检测结果。


整个检测流程无需人工干预,系统能够自动完成从样本处理到结果输出的全过程。


检测结果的解读同样实现了自动化。


GeneXpert软件会对检测数据进行分析处理,并将最终结果直接呈现在系统的“查看结果”窗口界面中。


值得一提的是,每个检测卡盒都采用了高度集成的设计,内部设有独立的样品加载区、样品处理区以及目标扩增区,同时还预装了完成所有检测步骤所需的全部试剂。


这种一体化设计不仅确保了检测流程的标准化和规范化,还大大降低了人为操作可能带来的误差风险,提高了检测结果的可靠性和重复性。


第三个问题,Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus测试在临床验证中的表现如何?


在多站点前瞻性临床研究的实际验证中,Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus检测系统展现出高度可靠的性能表现,其各项核心指标均达到优异水平。


在检测准确性方面,该系统针对四种目标病原体的阳性符合率(PPA)表现突出:对SARS-CoV-2的检测PPA达到98.7%,流感A为99.1%,流感B为96.6%,RSV则为97.8%。


同时,阴性符合率(NPA)同样出色,SARS-CoV-2的NPA为98.5%,流感A和B分别为98.5%与99.9%,RSV达到99.4%。


这些数据表明,无论是阳性样本还是阴性样本,该检测系统均能稳定、准确地识别目标病原体,与金标准方法的结果高度一致。


此外,在检测过程的稳定性方面,系统初始的非确定性结果率为2.7%,但经过重复检测后,这一比例显著降低至0.6%。


这一改进充分体现了系统设计的可靠性和重复性——即使初次检测出现不确定结果,通过简单的复检流程即可大幅提升结果的确定性,确保临床最终获得明确可靠的诊断依据。


综合这些性能指标可以看出,Xpert Xpress CoV-2/Flu/RSV plus检测系统在真实的临床环境中,能够为呼吸道病毒感染的检测与分析提供精准、稳定的支持,满足临床快速、准确诊断的需求。


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